A idéia nasceu dos membros da Associação dos Antigos Alunos do Colégio de São Bento "ASBA", que tinham como objetivo, desenvolver uma campanha permanente para educar jovens carentes, moradores dos bairros da periferia de São Paulo.

Para tornar efetiva esta decisão, criou-se em 21 de março de 1959, a Fundação Lar de São Bento que teve como seu mentor, o monge beneditino Dom Afonso Niessl O.S.B.

A finalidade da entidade era a de criação de lares, onde, em ambiente saudável, os jovens carentes pudessem receber orientação pedagógica, cristã e de ensino profissionalizante, habilitando-os ao exercício de uma atividade profissional no mercado de trabalho, na plena condição de cidadãos, em uma sociedade democrática.

Em 1960, o vigário da paróquia de Nossa Senhora da Candelária, da Vila Maria, cedeu a Casa Paroquial para abrigo e ensino de menores, implantando-se então, a Casa Dom Macário, homenagem da Fundação Lar de São Bento ao monge, que de 1907 a 1943 trabalhara em prol dos pequenos engraxates e jornaleiros, que exerciam suas atividades no centro da Cidade.

Devido a uma permuta com uma área doada por Isabel Leonor Martins Combes, a fundação Lar de São Bento tornou-se proprietária do terreno, onde a partir de 1967 iniciaria a construção da sede própria da Casa Dom Macário, um lote de 3.000 m2 na Rua Amambaí, 1415, no mesmo bairro da Vila Maria.